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　　厦门大学（343 项、2.16 亿元）、福州大学（187 项、7899 万元）、福建医科大学（142 项、6223 万元）、福建农林大学（119 项、6081 万元）、福建师范大学（68 项、2748 万元）、中国科学院福建物质结构研究所（45 项、2006 万元）、集美大学（44 项、1824 万元）、华侨大学（44 项、1803 万元）、福建中医药大学（41 项、1716 万元）、中国科学院城市环境研究所（28 项、1353 万元）。

　　基础研究氛围浓厚，多家单位创历年最佳。福建省各单位持续深耕基础研究领域，科研氛围浓厚，53 家单位共申报各类项目 9620 项，较 2024 年度增长了 14.8%，申报数再创新高，参与度持续提升。其中，厦门大学、福州大学、福建医科大学、集美大学、福建中医药大学、厦门理工学院、莆田学院、泉州师范学院、嘉庚创新实验室、清源创新实验室等多家单位立项数量均创本单位历年最佳成绩。福建农林大学获资助经费创新高，成为福建省第三家立项数超百项的省属高校。2024 年新获批成为国家自然科学基金依托单位的天津大学福州国际联合学院、福州外语外贸学院，此次也实现立项「0」的突破。

　　2025 年度，省自然科学基金立项 2224 项，总立项经费 23224 万元，其中科技计划经费 9061 万元，相比 2022 年度的 4250 万元增长了 113%。省青年科学基金自 2024 年设立以来，已累计立项支持 1004 项，培育成果斐然 —— 厦门大学张海、王波、郑越，福州大学江飞，嘉庚创新实验室张惠敏等青年学者，在 2024 年度省青年科学基金的支持下，成功获批国家自然科学基金青年科学基金 A 类、B 类项目，实现从「省级培育」到「国家级突破」的跃升。